首先，不同的CMS平台對SEO的支持程度不同。有些CMS預設的設置可能對搜索引擎優化並不友好，導致頁面加載速度慢、URL結構不清晰，或是無法輕易設置標題、元描述等重要SEO元素。這些都會影響網站的可見性。

其次，某些CMS系統可能缺乏靈活性，無法進行進一步的SEO調整。比如，預設的模板或插件可能限制了網站的功能，無法支持更高級的SEO技巧，如結構化數據標記（Schema Markup）或XML網站地圖生成。

此外，CMS更新也可能帶來SEO兼容性問題。網站更新後，有可能破壞已有的SEO設置，從而影響網站的排名。因此，選擇合適的CMS並定期維護網站，對於確保SEO策略的有效性至關重要。

總結來說，CMS與SEO之間的兼容性問題不容忽視，網站建設者應選擇支持SEO的CMS並進行定期的優化，確保網站在搜索引擎中獲得更好的排名。